各位老师请教个问题，我们公司在本市有直十几家营店，公司以半成品成本价格供应给各直营店，十几家门店是个体工商户独立核算申报缴纳税款。公司税务局现在的意思是直营店以分公司去核算，这对我们公司有什么坏处？